Efter Paris har Brno Europas næststørste ossuarium.

Allerede i begyndelsen af 1200-tallet fandtes der en kirkegård ved Skt. Jacobs Kirke (det område, der i dag er Jakubské náměstí). Byens voksende behov gjorde kirkegården for lille, og et særligt begravelsessystem blev indført: Gravene blev åbnet igen 10–12 år efter en begravelse, og resterne blev fjernet for at give plads til en ny krop. Knoglerne fra de oprindelige begravelser blev flyttet til særlige underjordiske områder – såkaldte ossuarier. Men også disse blev hurtigt fyldt, især på grund af pest- og koleraepidemier.

De reformer, som Josef II indførte i 1784, førte til lukning af kirkegårdene af hygiejnemæssige grunde. Resterne fra gravene blev flyttet til en krypt, kirkegårdsmuren blev revet ned, området omkring kirken blev belagt med tidligere gravsten, og ossuarium med over 50.000 begravede blev efterhånden glemt.

I dag er ossuarium ved Skt. Jacobs Kirke både en turistattraktion og et sted for eftertanke. Rundvisningen er meget imponerende, ikke mindst takket være den musik, der er komponeret specielt til stedet.