Den övre synagogan i Mikulov är en del av en av de mest omfattande judiska städerna i Tjeckien, som en gång i tiden var hem för den näst största judiska församlingen i Böhmen och Moravien. Det är den enda bevarade synagogan av de 12 som byggdes i Mikulov.
Den övre eller gamla synagogan uppfördes ursprungligen 1550, då en byggnad i renässansstil uppfördes på den plats där en tidigare synagoga hade rivits. Den fick sin nuvarande barocka form när den återuppbyggdes efter en brand 1719. Under denna återuppbyggnad uppfördes fyra korintiska kolonner i mitten av bönehallen, förbundna med varandra genom små halvcirkelformade arkader med ett kryssvalv i mitten. Detta förde synagogan närmare den österländska stilen och gav den dess unika karaktär sett ur dagens perspektiv. De sista gudstjänsterna hölls där 1938. Därefter förstördes eller togs inredningen bort. Efter kriget användes synagogan som butik innan den under 1970- och 1980-talen genomgick en grov renovering som tonade ner den religiösa karaktären. En genomgripande renovering som återställde synagogans ursprungliga utseende och utsmyckning genomfördes mellan 2011 och 2014 inom ramen för projektet Revitalisation of Jewish Landmarks - 10 Stars, som finansierades med EU-medel. Numera används den ibland för gudstjänster av Federation of Jewish Communities. För det mesta fungerar den dock som utställningslokal för Mikulovs regionala museum. Här finns också en plakett till minne av judiska martyrer.